Náhradná doprava bude za päť spojov z Komárna s odchodmi každé dve hodiny od 8:33 do 16:33 a štyroch opačne z Bajča s odchodmi v rovnakom intervale od 9:08 do 15:08.
Pre úpravu infraštruktúry na úseku Šaštín-Stráže – Šajdíkove Humence v okrese Senica od 27. apríla do 3. mája môžu cestujúci využiť miesto vlakov náhradnú autobusovú dopravu.